Флуоресцентный имиджинг
M.S. Kleshnin and I.V. Turchin, «Fluorescence diffuse tomography technique with autofluorescence removal based on dispersion of biotissue optical properties», Laser Phys. Lett. 10 075601 (2013)
Alina P. Ryumina, Ekaterina O. Serebrovskaya, Marina V. Shirmanova, Ludmila B. Snopova, Maria M. Kuznetsova, Ilya V. Turchin, Nadezhda I. Evteeva, Natalia Klementieva, Arkady F. Fradkov, Elena V. Zagaynova, Konstantin A. Lukyanov, Sergey A. Lukyanov, «Flavoprotein miniSOG as a genetically encoded photosensitizer for cancer cells» // Biochim Biophys Acta. Nov;1830(11):5059-67. doi: 10.1016/j.bbagen.2013.07.015. Epub 2013 Jul 20. (2013)
Marina V. Shirmanova, Ekaterina O. Serebrovskaya, Konstantin A. Lukyanov, Ludmila B. Snopova, Marina A. Sirotkina, Natalia N. Prodanetz, Marina L. Bugrova, Ekaterina A. Minakova, Ilya V. Turchin, Vladislav A. Kamensky, Sergey A. Lukyanov, and Elena V. Zagaynova, «Phototoxic effects of fluorescent protein KillerRed on tumor cells in mice», Journal of Biophotonics 6(3), 2013, pp. 283–290
А.В. Мелешина, Е.И. Черкасова, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, Е.В. Киселева, Э.В. Дашинимаев, М.В. Ширманова, С.А. Лукьянов, Е.В. Загайнова, «Исследование взаимодействия мезенхимных клеток и опухоли методами флюоресцентного биоимиджинга», Современные технологии в медицине, №4, 2012 с.7-16
Savitsky, Alexander P; Meerovich, Irina G; Zherdeva, Victoria V; Arslanbaeva, Lyaysan R; Burova, Olga S; Sokolova, Darina V; Treshchalina, Elena M; Baryshnikov, Anatoly Yu; Fiks, Ilya I; Orlova, Anna G; Kleshnin, Michael S; Turchin, Ilya V; Sergeev, Alexander M, «Three-dimensional in vivo imaging of tumors expressing red fluorescent proteins», Chapte 7 in Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) Volume: 872, Pages: 97-114 DOI: 10.1007/978-1-61779-797-2_7 Published: 2012
Фикс И.И., Кириллин М.Ю., Сергеева Е.А., Турчин И.В. Реконструкция положения объектов для диффузионной флуоресцентной томографии на основе гибридных моделей рассеяния света в биотканях. Известия ВУЗов. Радиофизика, 54(3), с. 219-232 (2011).
Ширманова М.В., Сироткина М.А., Клешнин М.С., Турчин И.В., Снопова Л.Б., Орлова А.Г., Балалаева И.В., Загайнова Е.В., Трещалина Е.М. Визуализация экспериментальных опухолей с использованием фотосенса на флуоресцентном диффузионном томографе // Нижегородский медицинский журнал.- №4.- 2008.- C. 7-12
Е.В. Загайнова, М.В. Ширманова, М.А. Сироткина, И.В. Балалаева, М.С. Клешнин, И.В. Турчин, Л.А. Седакова, В.И. Романенко, Е.М. Трещалина Мониторинг накопления фотосенсибилизаторов в опухоли методом диффузионной флуоресцентной томографии // Российский биотерапевтический журнал, 2008 г., т.7, №4, стр.30-33
Балалаева И.В., Ширманова М.В., Загайнова Е.В., Орлова А.Г., Каршиева С.Ш., Романенко В.И. «Неинвазивный мониторинг содержания фотосенсибилизаторов в тканях животных методом диффузионной флуоресцентной томографии» Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. 2008. № 3. С. 105-109.
И. В. Балалаева, А. Г. Орлова, Ю. А. Мацкова,М. В. Ширманова, И. В. Турчин, Н. Н. Зубова А. П. Савицкий, “Визуализация бактериальной инфекции методом флуоресцентной диффузионной томографии”, Вестник ННГУ, серия Биология, с. 28-33 (2006)
Turchin, I. V. Plehanov, V. I. Orlova, A. G. Kamenskiy, V. A. Kleshnin, M. S. Shirmanova, M. V. Shakhova, N. M. Balalaeva, I. V. Savitskiy, A. P. Fluorescence diffuse tomography of small animals with DsRed2 fluorescent protein. Laser Physics, 16(5), p. 741-746 (2006).
Оптическая диффузионная спектроскопия
V. O. Korhonen, T. S. Myllylä, M.Yu. Kirillin, A. Popov, A. Bykov, A.V. Gorshkov, E.A. Sergeeva, M. Kinnunen, V. Kiviniemi, “Light propagation in near-infrared spectroscopy of the human brain”, IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, in print (2014).
A.V. Gorshkov, M.Yu. Kirillin, “Monte Carlo simulation of brain sensing by optical diffuse spectroscopy”, Journal of Computational Science, 3, 498–503, (2012).
Масленникова А.В., Орлова А.Г., Голубятников Г.Ю., Каменский В.А., Плеханов В.И., Бабаев А.А., Снопова Л.Б., Иванова И.П., Пряникова Т.И., Шахова Н.М., Турчин И.В. Метод оптической диффузионной спектроскопии для in vivo исследования пространственного распределения зон гипоксии в ткани опухоли. Технологии живых систем, т. 8, №2, с. 38-43, 2011.
Орлова А.Г., Масленникова А.В., Голубятников Г.Ю., Каменский В.А., Шахова Н.М., Бабаев А.А., Снопова Л.Б., Иванова И.П., Плеханов В. И., Пряникова Т.И., Турчин И.В., Неинвазивное определение кислородного статуса экспериментальной опухоли методом оптической диффузионной спектроскопии. Биофизика Т. 56, №. 2, 2011, С 349-355
A.Maslennikova, A.Orlova, G.Golubjatnikov, V.Kamensky, V.Plekhanov, N. Shakhova, L.Snopova, A.Babaev, T.Prjanikova Non-invasive monitoring of tumor oxygen status after oxygen-modification by pentoxyphillin. Radiotherapy & Oncology, 96 (suppl.), 873 (2010).
Оптическая когерентная томография
П.Д. Агрба, Е.А. Бакшаева, Д.О. Эллинский, И.Л. Шливко, М.Ю. Кириллин “Роль механической компрессии при визуализации кожи человека методом кросс-поляризационной оптической когерентной томографии”, Современные технологии в медицине, 6(1) в печати (2014).
А.Н. Морозов, И.В.Турчин, «Метод оптической когерентной томографии с параллельным приемом сигнала с глубины и волоконно-оптическими модуляторами фазы», Квантовая Электроника 43(12), с. 1165-1169 (2013)
Губарькова Е.В., Кириллин М.Ю., Сергеева Е.А., Киселева Е.Б., Снопова Л. Б., Проданец Н.Н., Шарабрин Е.Г., Шахов Е.Б., Немирова С.В., Гладкова Н.Д., “Кросс-поляризационная оптическая когерентная томография в оценке структуры атеросклеротической бляшки”, Современные технологии в медицине, 5(4), 24-34 (2013)
Lev S. Dolin, Ekaterina A. Sergeeva, Ilya V. Turchin, «Correlation characteristics of optical coherence tomography images of turbid media with statistically inhomogeneous optical parameters», Journal of Quantitative Spectroscopy and Radiative Transfer 113(9), pp. 691-703, 2012
R. Su, M. Kirillin, P. Ekberg, A. Roos,E. Sergeeva, L. Mattsson “Optical coherence tomography for quality assessment of embedded microchannels in alumina ceramic”, Optics Express, 20(4), 4603-4618 (2012).
M. Kirillin, O. Panteleeva, E. Yunusova, E. Donchenko, and N. Shakhova “Criteria for pathology recognition in OCT of fallopian tubes“, Journal of Biomedical Optics, 17, 081413 (2012).
M.A. Sirotkina, M.V. Shirmanova, M.L.Bugrova, V.V. Elagin, .P.D. Agrba, M.Yu. Kirillin, V.A. Kamensky, E.V. Zagaynova, “Continuous optical coherence tomography monitoring of nanoparticles accumulation in biological tissues”, Journal of Nanoparticle Research, 13(1), 283-291 (2011).
Ширманова М.В., Балалаева И.В., Саунина Н.А., Загайнова Е.В., Орлова А.Г., Каменский В.А., Хлебцов Б.Н. «Исследование контрастирующих свойств золотых наночастиц для оптической когерентной томографии» Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. 2008. № 3. С. 92 -97.
I. Meglinski, M. Kirillin, V. Kuzmin and R. Myllylä, “Simulation of Polarization-Sensitive Optical Coherence Tomography images by Monte Carlo method”, Optics Letters, 33(14), 1581-1583 (2008).
Л.С. Долин, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, «Теневые шумы в оптических томограммах биотканей», Квантовая Электроника, 38(6), с. 543-550 (2008)
Е.В. Загайнова, О.С. Стрельцова, А.Г. Орлова, Е.Э. Юнусова «Комбинированное использование флюоресцентной цистоскопии и оптической когерентной томографии для диагностики раннего рака мочевого пузыря». Вестник РОНЦ. 2008. Т. 19, №2, С. 28-34.
M.Yu. Kirillin, E. Alarousu, T. Fabritius, R. Myllylä and A.V. Priezzhev “Visualization of paper structure by optical coherence tomography: Monte Carlo simulations and experimental study”, Journal of the European Optical Society — Rapid Publications, 2, 07031 (2007).
Е.В. Загайнова, М.В. Ширманова, В.А. Каменский, М.Ю. Кирилин, А.Г. Орлова, И.В. Балалева, Б.Н. Хлебцов Исследования контрастирующих свойств золотых наночастиц для метода ОКТ. Российские нанотехнологии, 2(7-8), с. 135-143 (2007).
V.V. Sapozhnikova, I.S. Kutis, S.D. Kutis, R.V. Kuranov, G.V. Gelikonov, D.V. Shabanov, V.A. Kamensky In vivo monitoring of seeds and plant tissue water absorption using optical coherence tomography and optical coherence microscopy. Chapter 6 in Plant Cell Diagnostics (Images, Biophysical and Biochemical Processes in Allelopathy). Enfield, Jersey, Plymoth: Science Publisher, p. 71-86 (2007).
А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Монте-Карло моделирование сигналов оптического когерентного томографа и его доплеровского варианта от модельных биологических тканей», Оптика и спектроскопия, 101 (1), 37-43 (2006).
М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, М.С. Федосеева, «Анализ вкладов различных кратностей рассеяния в сигнал оптического когерентного томографа от слоя крови методом Монте-Карло», Вестник МГУ.сер.3. Физика. Астрономия, №2, 36-40 (2006).
М.Ю. Кириллин, И.В. Меглинский, А.В. Приезжев, «Влияние кратностей рассеяния на формирование сигнала в оптической низко-когерентной томографии сильно рассеивающих сред», Квантовая электроника, 36(3), 247-252 (2006).
М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Ю.Хаст, Р.Мюллюля, «Оптическое просветление бумаги в оптической когерентной томографии: Монте-Карло моделирование», Квантовая электроника, 36(2), 174-180 (2006).
А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Восстановление профиля скоростей потока суспензии, погруженного в светорассеивающую среду, по сигналу оптического когерентного доплеровского томографа (Монте-Карло моделирование)», Квантовая электроника, 35(11), 1079-1082 (2005).
M.Yu. Kirillin, A.V. Priezzhev, V.V. Tuchin, R.K. Wang and R. Myllylä “Effect of red blood cell aggregation and sedimentation on optical coherence tomography signals from blood samples”, J. Phys. D: Appl. Phys. 38 , pp. 2582-2589 (2005)
А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев. Монте-Карло моделирование сигнала оптического когерентного доплеровского томографа: влияние концентрации частиц в потоке на восстановленный профиль скоростей, Квантовая электроника, 35, 135-139 (2005).
Г.В. Геликонов, Л.С. Долин, Е.А. Сергеева, И.В. Турчин, «О проявлении эффектов многократного обратного рассеяния в оптических томограммах слоистых мутных сред», Известия вузов. Радиофизика, т. 46, №7, 2003. C. 628-640.
В.М.Геликонов, Г.В. Геликонов, С.Ю.Ксенофонтов, Р.В.Куранов, А.Н.Морозов, А.В.Мяков, А.А. Туркин, И.В. Турчин, Д.В.Шабанов, «Новые подходы к широкополосной волоконно-оптической интерферометрии для оптической когерентной томографии», Известия вузов. Радиофизика, т. 46, №7, 2003. C. 610-627.
Снопова Л.Б., Гладкова Н.Д., Шахова Н.М., Загайнова Е.В., Кузнецова И.А., Проданец Н.Н., Куранов Р.В., Геликонов В.М., Турчин И.В., Сапожникова В.В., Каменский В.А. ”Перспективные морфологические исследования покровных тканей человека в интерпретации изображений, полученных методом оптической когерентной томографии” // Нижегородский медицинский журнал. — 2003. — N. 1. — P. 57-61
Ilya V. Turchin, Ekaterina A. Sergeeva, Lev S. Dolin, Vladislav A. Kamensky, “Estimation of Biotissue Scattering Properties from OCT Images Using a Small-Angle Approximation of Transport Theory”, Laser Physics, v.13, No. 12, 2003 pp. 1524-1529
Roman V. Kuranov, Sergey N. Bagayev, Valentin M. Gelikonov, Grigory V. Gelikonov, Evgeny S. Kargapoltsev, Alexander M. Razhev, Ilya V. Turchin, Andrey A. Zhupikov, “Optical coherence tomography for in situ monitoring of laser corneal ablation”, Journal of Biomedical Optics, Vol. 7, No. 4, 2002. – pp. 633-642.
R.V. Kuranov, V.V. Sapozhnikova, I.V. Turchin, E.V. Zagainova, V.M. Gelikonov, V.A. Kamensky, L.B. Snopova, and N.N. Prodanetz, “Complementary use of cross-polarization and standard OCT for differential diagnosis of pathological tissues”, Optics Express, Vol. 10, No. 15, PP. 707-713, 2002.
N.M. Shakhova, V.M. Gelikonov, V.A. Kamensky, R.V. Kuranov, and I.V. Turchin, “Clinical Aspects of the Endoscopic Optical Coherence Tomography and the Ways for Improving Its Diagnostic Value”, Laser Physics, Vol. 12, No. 4, 2002. – pp. 617-626.
S.N.Bagayev, V.M.Gelikonov, E.S.Kargapoltsev, R.V.Kuranov, A.M.Razhev, E.V.Turchin, A.A. Zhupikov, «The excimer laser system for refractive surgery assisted by optical coherence tomograph», Laser Physics, Vol. 11, No. 11, 2001. — P. 1224-1227.
Флуоресцентная микроскопия
А.А. Брилкина, Л.В. Дубасова, Е.А. Павлова, И.В. Балалаева, А.Г.Орлова, Е.А.Сергеева, А.Р.Катичев, Н.М.Шахова Исследование внутриклеточного распределения фотосенсибилизаторов трех типов в опухолевых клетках человека методом лазерной сканирующей микроскопии. Технологии живых систем, №8, 32-39 (2011).
Е.А. Сергеева, А.Р. Катичев, М.Ю. Кириллин, “Формирование сигнала двухфотонной флуоресцентной микроскопии в условиях сильного рассеяния: теоретическое и численное моделирование”, Квантовая Электроника, 40(12), 1053–1061 (2010).
Акустическая и оптико-акустическая диагностика биотканей
П.В. Субочев, А.Г. Орлова, И.В. Турчин, А.М. Сергеев, «Метод бимодальной оптоакустической и ультразвуковой микроскопии для одновременной структурной и функциональной дианостики биотканей», Доклады АН 454(4) (2014) //принято к публикации
Аносов А.А., Беляев Р.В., Вилков В.А., Казанский А.С., Мансфельд А.Д., Субочев П.В. «Динамическое восстановление глубинной температуры методом акустотермографии с помощью нейронных сетей», Акустический журнал, 59.6, 2013, с. 768-772
P.Subochev, A.Katichev, A.Morozov, A. Orlova, V. Kamensky, I.Turchin // Simultaneous photoacoustic and optically mediated ultrasound microscopy: phantom study // Optics Letters 37(22), 2012, pp. 4606-4608
Сироткина М.А., Елагин В.В., Субочев П.В., Денисов Н.Н., Ширманова М.В., Загайнова Е.В. Лазерная гипертермия опухолей с золотыми наночастицами под контролем оптической когерентной томографии и акустотермометрии // Биофизика. 2011. Т.56, вып.6. 1142-1146.
Резник А.Н., Субочев П.В. «К теории акустотермометрии водоподобных сред: влияние квазистатического поля, сильного поглощения и диаграммы направленности», Акустический журнал, 56.1, 2010, с. 113-123
П.В. Субочев, А.Д.Мансфелъд, Р.В. Беляев «Многочастотная акустическая термотомография при лазерной гипертермии: физическое моделирование», Вестник ННГУ, 5.1, 2010, с. 67-74
Е.В.Кротов, А.М.Рейман, П.В.Субочев «Синтез акустической линзы Френеля для акустояркостной термометрии», Акустический журнал, 53.6, 2007, с. 779-785.
Е.В.Кротов, А.М.Рейман, П.В. Субочев «Учет частотной зависимости коэффициента акустического поглощения при решении задач акустояркостной термометрии», Изв. ВУЗов РАДИОФИЗИКА, Т.49, №6, 2006, с. 478-488.
По связанным темам
А.Д. Крайнов, А.М. Мокеева, Е.А Сергеева, П.Д. Агрба, М.Ю. Кириллин, «Оптические свойства биотканей мыши и их оптических фантомов» Оптика и спектроскопия, 115(2), 47-54 (2013).
Х.С.С. Сорвойя, Т.С. Мюллюля, М.Ю. Кириллин, Е.А. Сергеева, Р.А. Мюллюля, А.А. Элесуд, Ю. Никкинен, О. Тервонен, В. Кивиниеми, “Неинвазивный МРТ-совместимый волоконно-оптический прибор для функциональной рефлектометрии мозга человека в оптическом и ближнем ИК диапазонах”, Квантовая Электроника, 40(12), 1067-1073 (2010).
Каменский В.А., Морозов А.Н., Мяков А.В., Агрба П.Д., Шахова Н.М. Эндоскопический кросс-поляризационный спектрометр-прибор для пункционной диагностики. Оптика и спектроскопия, 109(3), с. 434-438 (2010).
М.Ю. Кириллин, А.В. Быков, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля «Использование временного стробирования при измерении уровня глюкозы в трехслойной модели биоткани с помощью сверхкоротких лазерных импульсов», Квантовая Электроника, 38(5), 486-490 (2008).
А.В. Быков, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, Р. Мюллюля, “Моделирование сигнала пространственно-разрешенной рефлектометрии от трехслойной среды с сильным рассеянием применительно к проблеме определения содержания глюкозы в коже человека”, Квантовая Электроника, 36 (12), 1125-1130 (2006).
Е.А. Сергеева, М.Ю. Кириллин, А.В. Приезжев, «Распространение фемтосекундного импульса в рассеивающей среде: теоретический анализ и численное моделирование», Квантовая Электроника, 36 (11), 1023-1031 (2006).